서복사지는 원래의 사찰명은 알 수 없으나 그 동안의 발굴조사 결과 남북자오선상에 중문―탑(목탑)―금당순으로 건물을 배치하였던 전형적인 백제 사찰지이다.

이 사지에서 출토된 치미, 금동판, 소조불두, 금동제 과판, 청동제 등개, 벽화편 등으로 보아 백제왕실의 원찰성격이 강한 중요사찰지로서, 사지의 축조공법 또한 정교하여 백제사원 양식 연구에 중요한 유적으로서 보존가치가 크다.