공주 마곡사 대공보전 소조비로자나불좌상은 그 양식적 특징으로 미루어 조선 전기, 그 중에서도 16세기에 조성된 불상으로 추정되며, 정확한 제작 연대는 현재로서는 확인할 수 없지만 신체 비례와 착의법, 옷주름 표현의 특징 등에서 조선 전기 불상의 특징을 잘 드러내고 있어 유산적 가치가 높으며, 조선 전기 대형 소조불의 특징을 잘 드러내는 희소성 있는 사례임.

조선 전기에 조성된 불상과 같은 양식을 공유하고, 재료적 특징에서 희소성을 갖추고 있으며, 우수한 표현기법과 특징적인 수인을 결하고 있어 의미와 가치가 있음.