백제 웅진시대 왕도와 남북국시대 웅천주의 주도였던 역사성을 계승하고 983년(고려 성종 2) 전국 12목 중의 하나로 설치된 공주목은 고려 현종의 파천(1011), 조선 인조의 파천(1624) 등 역사적 사건의 현장이었음.

공주목 관아지는 고려, 조선시대 충청지역의 정치, 행정, 문화를 선도한 수부도시 공주를 상징하는 문화유산으로 역사적 가치가 높음.