「여수 거문도 근대역사문화공간」은 1885년 영국군의 거문도 점령 사건 이후 각 시기별 항만시설, 군사시설, 수산업관련 시설 등 역사적 흔적이 남아 있으며, 각 시기를 대표하는 다양한 근대문화유산들이 곳곳에 분포하고 있어 근대역사문화공간인 면적 단위 문화유산으로서 등록할 가치가 있다.