고성남씨족보는 대전 세거 고성남씨가의 필사본 족보로 시조인 군용(君用)의 자손 가운데 9세 금(琴)의 자손록이다. 본보의 편찬 시기는 본보의 서문과 수록 인물의 생몰년 등을 종합해보면 1612년에 작성된 초본을 개수하여 17세기 말 혹은 18세기 초반에 작성된 것으로 추정된다.
본보는 외손을 본손과 마찬가지로 세대의 제한 없이 본보 간행시까지 수록한 내외자손보라는 특징이 있으며 이들은 공주(현 대전) 자운동과 인접지역인 회덕 방축동 등에 세거하였다.
따라서 본보는 현 대전세거 고성남씨가의 내외자손록이라고 할 수 있다.